Wariant BIZNES programu WAPRO KAPER skierowany jest dla przedsiębiorstw handlowych, usługowych lub produkcyjnych. Zgodnie z warunkami licencji pozwala na obsługę do trzech oddziałów firmy jeśli posiadają ten sam numer NIP lub trzech firm, jeśli każda z nich ma wykupioną oddzielną licencję. Program może być zainstalowany na wielu stanowiskach, możemy również utworzyć dowolną liczbę użytkowników programu. W odróżnieniu od wariantu podstawowego w wariancie tym istnieje możliwość rozliczania dowolnej liczby samochodów oraz środków trwałych. Od tego wariantu możliwa jest obsługa pracowników (obsługa wynagrodzeń, umowy zlecenie i umowy o dzieło, przelewy wynagrodzeń, tworzenie deklaracji PIT-11, PIT-40, PIT-4R, PIT-8AR, IFT-1/IFT-1R.

Program WAPRO KAPER (dawniej znany pod nazwą WF-KaPeR) jest programem przeznaczonym do prowadzenia uproszczonej księgowości opartej na księdze przychodów i rozchodów, ryczałtowej ewidencji sprzedaży, a także rozliczenia dochodów z najmu. Po dokonaniu procesu instalacji aplikacja jest gotowa do pracy bez potrzeby wstępnej konfiguracji. Wymaga wprowadzenia do niej jedynie podstawowych danych, a wiele operacji związanych np. z wprowadzaniem zapisów do rejestrów VAT lub naliczaniem składek ubezpieczeniowych zostało zautomatyzowanych aby oszczędzić czas i zmniejszyć ryzyko popełnienia błędu. Program jest w pełni dostosowany do obowiązującego prawa i na bieżąco aktualizowany, co odciąża użytkownika od konieczności stałego śledzenia zmieniających się przepisów. Do dyspozycji mamy wiele gotowych, automatycznie wypełnianych formularzy deklaracji podatkowych VAT, PIT i NIP ze wszystkimi załącznikami. WAPRO KAPER obsługuje również deklaracje w formie elektronicznej. Aplikacja wykorzystuje formularze pochodzące z największej, dostępnej bazy dokumentów elektronicznych w Polsce www.iform.pl. Program jest oparty na technologii klient- serwer co oznacza że składa się z dwóch części: bazy danych Microsoft SQL Server w wariancie Express Edition którą otrzymujemy bezpłatnie oraz z aplikacji użytkowej WAPRO KAPER. Wszystkie wprowadzane w aplikacji dane trafiają do bazy danych z którą aplikacja musi być połączona. Do dyspozycji mamy bogaty system zapytań filtrujących, który pozwala łatwo wyszukiwać i selekcjonować informacje według dowolnych kryteriów. Użytkownik na własny użytek może zbudować dowolne wyrażenie filtrujące. Możemy hierarchicznie segregować dane poprzez drzewa filtrów, które są dostępne w większości okien programu. Program wyróżnia również duża ilość wbudowanych zestawień i raportów, jak również możliwością podpinania zewnętrznych raportów np. wykonanych w technologii CRYSTAL REPORTS.

Program WAPRO KAPER posiada moduł importu zapisów bezpośrednio z programu WAPRO MAG pracującego na wspólnej bazie danych oraz zapisów z zewnętrznych plików co umożliwia współpracę z programem WAPRO MAG zainstalowanym na innym komputerze lub poza siecią, a także z programem WAPRO FAKTURKA. Moduł ten posiada m.in. możliwość konfiguracji typu importowanego dokumentu o wybór rejestru VAT oraz opcję blokowania importu dokumentów wcześniej zaksięgowanych. Program współpracuje również z programem WAPRO ANALIZY, dzięki czemu możemy dodatkowo uzyskać możliwość wykonywania wielowymiarowych, przekrojowych analiz, w postaci czytelnych zestawień tabelarycznych i wykresów, niezbędnych do oceny trendów zmian procesów zachodzących w firmie, analiz porównawczych i innych.

WAPRO KAPER umożliwia współpracę z rozprowadzanym przez ZUS programem Płatnik. Formatem pliku wymiany danych jest XML  (Uwaga: od wersji 8.41.2 został zaktualizowany format pliku wymiany danych XML z programem Płatnik, dlatego do prawidłowego działania programu wymagana jest aktualna wersja programu Płatnik - co najmniej musi to być wersja 10.02). Na podstawie zgromadzonych w programie danych tworzy elektroniczne dokumenty zgłoszeniowe i rozliczeniowe dla ZUS.

Program jest zintegrowany ze środowiskiem Windows. Stwarza to nieograniczone możliwości przetwarzania danych zawartych w aplikacji przez aplikacje Windowsowe np. Word, Excel, itp..